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这是我见过的最漂亮的小麦染色体图 [复制链接]

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见字如面,一图胜千言。

记的第一次在小麦研究联盟上写文章,是给大家分享了一个高密度分子标记画图的R脚本。这篇文章后面有同学留言说,要是早一年看到这个脚本,他芯片的文章就能发表在一区了。

如何画一幅很漂亮的小麦染色体框架图?我自己也一直在寻找答案。在基因组时代,这么一个高频率使用的漂亮的图,一定能提高我们论文的颜值。科学的另一面就是艺术,作为小麦研究联盟的一员,我也一直在拿这一点要求自己。

最近受到西北农林姜雨老师课题组发表在Genomebiology文章上的启发,我终于写出来画出一个漂亮染色体图的R脚本。

至少我自己目前对这幅图很满意,我认为这是目前为止我见过的最漂亮的小麦染色体框架图,接受反驳,欢迎留言拍砖、投稿。

这个图的关键是利用R画多边形的函数polygon。弧度的绘制使用的x^2+y^2=1这个函数产生相应的坐标(关键部分已剧透)。

后续会更新成一个在线版的供大家使用(先给自己挖个坑),但是出于后续发表文章的需要,暂时不打算公开这个脚本代码。如果有发表文章急需的同学,可以后台留言,承诺署名小麦研究联盟的话,我们可以考虑私下提供。

往期文章:

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小麦GWAS-QTL结果结合高密度分子标记作图

Carthagene-遗传图谱构建软件构建高密度遗传图谱GWAS的困境和遗传模型的新思基因组重测序揭示六倍体普通小麦的遗传多样性来源于频繁的种内和种间杂交wheatomics

千言万语总是情,包个红包行不行

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